Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM8AO60220 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMM8AO60220 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.7 ms