Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DGG1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DGG1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DGG1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DGG1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DGG1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DGG1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DGG1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DGG1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DGG1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DGG1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DGG1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DGG1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DGG1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DGG1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DGG1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DGG1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DGG1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DGG1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DGG1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DGG1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B4DGG1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DGG1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DGG1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DGG1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DGG1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DGG1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DGG1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DGG1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DGG1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DGG1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DGG1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DGG1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DGG1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DGG1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4DGG1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4DGG1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4DGG1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4DGG1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4DGG1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4DGG1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4DGG1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DGG1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DGG1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DGG1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DGG1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DGG1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DGG1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DGG1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DGG1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DGG1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DGG1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DGG1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DGG1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DGG1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DGG1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DGG1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DGG1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DGG1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DGG1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DGG1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DGG1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DGG1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DGG1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DGG1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
B4DGG1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
B4DGG1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B4DGG1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DGG1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DGG1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DGG1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DGG1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DGG1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms