Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHA12Q9UN75 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PCDHA12Q9UN75 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA12Q9UN75 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms