Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX25Q9UHL0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX25Q9UHL0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms