Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPG2Q9UBF2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPG2Q9UBF2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms