Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS4Q9NQG7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS4Q9NQG7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms