Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHIPQ96QV1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHIPQ96QV1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms