Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPNS2Q96L46 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPNS2Q96L46 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
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