Protein–RNA interactions for Protein: Q86SI9

C5orf38, Protein CEI, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf38Q86SI9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf38Q86SI9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C5orf38Q86SI9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms