Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFCAB12Q6NXP0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB12Q6NXP0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms