Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHYHD1Q5SRE7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms