Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.3 ms