Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 AC004381.2-201ENST00000637768 1329 ntBASIC8.92□□□□□ -0.983e-10■■■■■ 46.3
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SF3B4Q15427 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.79e-11■■■■■ 46.2
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SF3B4Q15427 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.543e-8■■■■■ 45.8
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SF3B4Q15427 NBEAL2-207ENST00000469349 540 ntTSL 213.04□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 45.7
SF3B4Q15427 CBX8-203ENST00000427800 665 ntTSL 217.68■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 45.7
SF3B4Q15427 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 45.7
SF3B4Q15427 CBX8-202ENST00000413392 777 ntTSL 315.64■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 45.7
SF3B4Q15427 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 210.23□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 45.7
SF3B4Q15427 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 45.7
SF3B4Q15427 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 45.7
SF3B4Q15427 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 36.59□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 45.7
SF3B4Q15427 AMBP-202ENST00000466610 579 ntTSL 39.29□□□□□ -0.922e-9■■■■■ 45.7
SF3B4Q15427 ATG4B-213ENST00000460211 871 ntTSL 213.63□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 45.6
SF3B4Q15427 ATG4B-210ENST00000428861 580 ntTSL 29.65□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 45.6
SF3B4Q15427 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.543e-7■■■■■ 45.6
SF3B4Q15427 PUF60-218ENST00000531995 631 ntTSL 316.59■□□□□ 0.253e-9■■■■■ 45.6
SF3B4Q15427 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 45.6
SF3B4Q15427 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 45.6
SF3B4Q15427 CNOT3-207ENST00000496327 784 ntTSL 515.1■□□□□ 0.016e-8■■■■■ 45.6
SF3B4Q15427 OGFR-203ENST00000450048 553 ntTSL 39.07□□□□□ -0.961e-9■■■■■ 45.6
SF3B4Q15427 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.691e-13■■■■■ 45.6
SF3B4Q15427 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.51e-13■■■■■ 45.6
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