Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL19A1Q14993 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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