Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms