Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC2P49815 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC2P49815 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC2P49815 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC2P49815 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC2P49815 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC2P49815 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC2P49815 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC2P49815 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC2P49815 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC2P49815 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC2P49815 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC2P49815 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC2P49815 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC2P49815 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC2P49815 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC2P49815 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC2P49815 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC2P49815 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC2P49815 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC2P49815 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC2P49815 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC2P49815 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC2P49815 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC2P49815 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSC2P49815 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSC2P49815 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSC2P49815 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSC2P49815 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSC2P49815 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC2P49815 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC2P49815 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC2P49815 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC2P49815 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC2P49815 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC2P49815 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC2P49815 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC2P49815 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC2P49815 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC2P49815 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC2P49815 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC2P49815 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC2P49815 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC2P49815 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC2P49815 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC2P49815 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC2P49815 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC2P49815 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC2P49815 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC2P49815 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC2P49815 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC2P49815 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC2P49815 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC2P49815 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC2P49815 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC2P49815 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC2P49815 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC2P49815 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC2P49815 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC2P49815 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC2P49815 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC2P49815 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC2P49815 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC2P49815 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC2P49815 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC2P49815 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC2P49815 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC2P49815 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC2P49815 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC2P49815 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC2P49815 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC2P49815 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC2P49815 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC2P49815 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC2P49815 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC2P49815 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC2P49815 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSC2P49815 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSC2P49815 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC2P49815 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC2P49815 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC2P49815 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC2P49815 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC2P49815 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC2P49815 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC2P49815 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC2P49815 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC2P49815 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC2P49815 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC2P49815 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC2P49815 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC2P49815 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC2P49815 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC2P49815 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC2P49815 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC2P49815 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC2P49815 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC2P49815 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC2P49815 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC2P49815 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms