Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB5P28074 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms