Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOL3O95236 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOL3O95236 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOL3O95236 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOL3O95236 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOL3O95236 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOL3O95236 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOL3O95236 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOL3O95236 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOL3O95236 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOL3O95236 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOL3O95236 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOL3O95236 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOL3O95236 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOL3O95236 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOL3O95236 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOL3O95236 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOL3O95236 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOL3O95236 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOL3O95236 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOL3O95236 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOL3O95236 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOL3O95236 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOL3O95236 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOL3O95236 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOL3O95236 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOL3O95236 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOL3O95236 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOL3O95236 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOL3O95236 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOL3O95236 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOL3O95236 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOL3O95236 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOL3O95236 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOL3O95236 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOL3O95236 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOL3O95236 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOL3O95236 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOL3O95236 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOL3O95236 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOL3O95236 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOL3O95236 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOL3O95236 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOL3O95236 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOL3O95236 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOL3O95236 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOL3O95236 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOL3O95236 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOL3O95236 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOL3O95236 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOL3O95236 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOL3O95236 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOL3O95236 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOL3O95236 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOL3O95236 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOL3O95236 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOL3O95236 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOL3O95236 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOL3O95236 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOL3O95236 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL3O95236 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL3O95236 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL3O95236 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL3O95236 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL3O95236 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL3O95236 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOL3O95236 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOL3O95236 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL3O95236 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL3O95236 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL3O95236 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL3O95236 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL3O95236 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOL3O95236 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL3O95236 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL3O95236 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL3O95236 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL3O95236 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL3O95236 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL3O95236 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL3O95236 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL3O95236 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL3O95236 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOL3O95236 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms