Protein–RNA interactions for Protein: O15164

TRIM24, Transcription intermediary factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM24O15164 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM24O15164 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM24O15164 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM24O15164 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms