Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC182A6NF36 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC182A6NF36 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms