Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD4AQ9UPU9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4AQ9UPU9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms