Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC3GQ9HC16 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3GQ9HC16 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms