Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms