Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC106Q9BWC9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms