Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRNP25Q9BV90 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms