Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RSG1Q9BU20 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms