Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3GL3Q99963 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms