Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI25

CNIH2, Protein cornichon homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2Q6PI25 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH2Q6PI25 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNIH2Q6PI25 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms