Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBAP2Q5T6F2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBAP2Q5T6F2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms