Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX3Q13761 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX3Q13761 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms