Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCGQ13326 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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