Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP2R2BQ00005 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms