Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2C1P98194 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP2C1P98194 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms