Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNFP41002 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNFP41002 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNFP41002 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNFP41002 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNFP41002 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNFP41002 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNFP41002 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNFP41002 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNFP41002 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNFP41002 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNFP41002 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNFP41002 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNFP41002 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNFP41002 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNFP41002 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNFP41002 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNFP41002 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNFP41002 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNFP41002 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNFP41002 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNFP41002 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNFP41002 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNFP41002 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNFP41002 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNFP41002 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNFP41002 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNFP41002 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNFP41002 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNFP41002 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNFP41002 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNFP41002 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNFP41002 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNFP41002 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNFP41002 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNFP41002 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNFP41002 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNFP41002 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNFP41002 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNFP41002 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNFP41002 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNFP41002 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNFP41002 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNFP41002 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNFP41002 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNFP41002 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNFP41002 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNFP41002 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNFP41002 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNFP41002 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNFP41002 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNFP41002 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNFP41002 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNFP41002 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNFP41002 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNFP41002 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNFP41002 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNFP41002 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNFP41002 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNFP41002 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNFP41002 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNFP41002 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNFP41002 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNFP41002 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNFP41002 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNFP41002 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNFP41002 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNFP41002 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNFP41002 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNFP41002 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNFP41002 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNFP41002 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms