Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCAP28676 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCAP28676 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCAP28676 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCAP28676 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCAP28676 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCAP28676 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCAP28676 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCAP28676 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GCAP28676 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCAP28676 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCAP28676 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCAP28676 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCAP28676 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCAP28676 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCAP28676 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCAP28676 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCAP28676 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCAP28676 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GCAP28676 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCAP28676 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCAP28676 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCAP28676 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCAP28676 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCAP28676 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCAP28676 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCAP28676 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GCAP28676 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCAP28676 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCAP28676 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCAP28676 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCAP28676 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCAP28676 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCAP28676 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCAP28676 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCAP28676 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCAP28676 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCAP28676 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCAP28676 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCAP28676 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GCAP28676 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCAP28676 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCAP28676 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCAP28676 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCAP28676 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCAP28676 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCAP28676 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCAP28676 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCAP28676 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCAP28676 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCAP28676 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCAP28676 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCAP28676 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCAP28676 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCAP28676 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCAP28676 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCAP28676 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCAP28676 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCAP28676 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCAP28676 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCAP28676 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCAP28676 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCAP28676 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GCAP28676 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCAP28676 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCAP28676 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCAP28676 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCAP28676 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCAP28676 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCAP28676 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GCAP28676 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCAP28676 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCAP28676 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCAP28676 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCAP28676 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCAP28676 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GCAP28676 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCAP28676 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCAP28676 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCAP28676 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCAP28676 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCAP28676 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCAP28676 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCAP28676 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCAP28676 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCAP28676 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCAP28676 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms