Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00869P0C866 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00869P0C866 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms