Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RECQL4O94761 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RECQL4O94761 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms