Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FNDC3AQ9Y2H6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNDC3AQ9Y2H6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC3AQ9Y2H6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms