Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD5

PICK1, PRKCA-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICK1Q9NRD5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PICK1Q9NRD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICK1Q9NRD5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICK1Q9NRD5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms