Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
XPNPEP3Q9NQH7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
XPNPEP3Q9NQH7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPNPEP3Q9NQH7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.5 ms