Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARD6AQ9NPB6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms