Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms