Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3GL3Q99963 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms