Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGAP3Q96FM1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms