Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPRTQ96BW1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPRTQ96BW1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.3 ms