Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFT1Q96AA3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms