Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL26A1Q96A83 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL26A1Q96A83 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms