Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNERQ8NFT8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNERQ8NFT8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNERQ8NFT8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms