Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1CQ8N431 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASGEF1CQ8N431 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RASGEF1CQ8N431 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASGEF1CQ8N431 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASGEF1CQ8N431 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASGEF1CQ8N431 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASGEF1CQ8N431 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASGEF1CQ8N431 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASGEF1CQ8N431 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASGEF1CQ8N431 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASGEF1CQ8N431 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms