Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ANKRD35Q8N283 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD35Q8N283 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD35Q8N283 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms